長沙晚報(bào)掌上長沙10月20日訊（全媒體記者 彭放 通訊員 王涵）自疫情發(fā)生以來，隨著精準(zhǔn)化防控的開展，“基因測序”一詞常常被提及，除了核酸檢測，大家也開始關(guān)注基因測序的結(jié)果。疫情源頭在哪里？除了流行病學(xué)調(diào)查，還有沒有更簡便精準(zhǔn)的方法來確定傳播鏈條？這些問題都要借助基因測序的科技力量一一解開。今日，記者跟隨長沙市疾控中心基因測序項(xiàng)目組，了解新冠病毒全基因組測序的方方面面。

　　長沙市疾控中心基因測序項(xiàng)目組骨干成員、微生物檢驗(yàn)科技師黃政介紹，新冠病毒基因測序是對(duì)陽性病例鼻咽拭子標(biāo)本中新冠病毒核苷酸序列的獲取。這種基因測序技術(shù)是基于納米孔的三代基因測序，從而能夠在較短時(shí)間內(nèi)獲得新冠病毒的全基因組序列，結(jié)合流行病學(xué)資料，既可以判斷新冠病毒疫情的感染來源，又可以對(duì)多個(gè)病例感染的病毒基因進(jìn)行測序，判斷是否為同一傳播鏈，從而為疫情防控方案的制定提供重要依據(jù)。這項(xiàng)技術(shù)已經(jīng)成為目前新冠病毒溯源分型的主要手段。

　　如果說核酸檢測是為了發(fā)現(xiàn)病例，那么，基因測序是為了對(duì)發(fā)現(xiàn)的病例進(jìn)一步進(jìn)行流行病學(xué)分子溯源，協(xié)助現(xiàn)場流行病學(xué)調(diào)查查找感染源頭和傳播鏈條。譬如可以判斷為外省或外地輸入病例，甚至可以根據(jù)核苷酸突變的情況判斷為本地病例的二代傳播、三代傳播。簡單的說，病毒基因測序用于流行病學(xué)的分子溯源調(diào)查，相當(dāng)于病毒的“親子鑒定”。

　　“基因測序技術(shù)發(fā)展很快，從一代、二代，發(fā)展到目前的三代。長沙市疾控中心實(shí)驗(yàn)室使用的就是三代測序設(shè)備。”黃政介紹，和二代測序需要36～48小時(shí)相比，而三代測序的時(shí)間縮短到了12小時(shí)內(nèi)。流調(diào)溯源時(shí)間縮短，為疫情防控措施的制定節(jié)約了寶貴的時(shí)間和資源，有利于更精準(zhǔn)的防控，減輕對(duì)社會(huì)和經(jīng)濟(jì)的壓力。

　　近一個(gè)月，團(tuán)隊(duì)共對(duì)35份樣本開展了三代測序，結(jié)合流行病學(xué)調(diào)查，精準(zhǔn)判斷多起感染來源和傳播鏈條。國慶期間，一名本地病例的感染源頭一時(shí)難以確定。盡管經(jīng)過流行病學(xué)調(diào)查，發(fā)現(xiàn)其與一名外省輸入病例可能有時(shí)空交集，但流調(diào)隊(duì)員反復(fù)查看現(xiàn)場監(jiān)控視頻，未發(fā)現(xiàn)兩人共同暴露于同一個(gè)環(huán)境中。最終，通過三代基因測序，發(fā)現(xiàn)這兩人的病毒基因序列高度同源，判斷兩人為同一傳播鏈，為流行病學(xué)調(diào)查指明了方向。

　　長沙市疾控中心基因測序項(xiàng)目組是一個(gè)平均年齡不到30歲的年輕團(tuán)隊(duì)。他們?cè)诔袚?dān)繁重的新冠核酸日常檢測工作之余，一旦本市出現(xiàn)新冠病毒核酸檢測陽性人員，項(xiàng)目組便馬上對(duì)陽性樣品啟動(dòng)基因測序。由于每天核酸檢測大多晚上才出結(jié)果，基因測序工作往往在后半夜進(jìn)行，項(xiàng)目組不分晝夜，分秒必爭，絕大多數(shù)三代基因測序分析結(jié)果在凌晨3時(shí)以后發(fā)出。他們用“白加黑、連軸轉(zhuǎn)”的辛勤付出，為長沙市疫情防控流調(diào)溯源提供數(shù)據(jù)支撐，發(fā)揮了實(shí)驗(yàn)室的“一錘定音”作用。